Com o intuito de descentralizar as ações do Comando-Geral da PMERJ, existem Comandos Intermediários chamados de Comando de Policiamento de Área (CPA), que são responsáveis pela organização e mobilização do policiamento em cada região do Estado do Rio de Janeiro, adaptando a aplicação das diversas modalidades de policiamento às necessidades locais.
Comandos Intermediários
1º CPA – Rio de Janeiro
3° CPA – Mesquita
5° CPA – Volta Redonda
6° CPA – Campos dos Goitacazes
7° CPA – Petrópolis
CPP – Rio de Janeiro
CmdoUOpE – Rio de Janeiro
As exceções a essa regra são o Comando de Unidades Operacionais Especiais (Cmdo UOpE) que controla Unidades da Polícia Militar cuja área de atuação se estende por todo território fluminense e o Comando de Policia Pacificadora (CPP), que tem sob seu controle os grupamentos que policiam áreas carentes da capital do Estado e da cidade de Niterói.